A rendszerváltás utáni évekből külön kezelten őrzik az általános iratoktól elkülönített, speciális tanulmányi kérdésekkel foglalkozó iratokat, szabályzatokat.
Ebben az állagban a gyulafehérvári szeminárium hallgatói nyilvántartásai találhatóak. A kezdeti időszakból 1753-tól 1782-ig egy latin nyelvű napló áll rendelkezésre, amelyben azonban megvan a kispapok teljes névsora és az események részletes feljegyzése. A visszaállítás utáni időszakból az iratok közül kiválogatott hallgatói névsorokat helyeztük el az állagban. 1849-től már részletes nyilvántartás áll a kutatók rendelkezésére. Az állag végén két másik típusú, de a korszakra vonatkozó tanulmányi könyvet helyeztünk el. Az iratok nagy forrásértékkel bírnak az erdélyi katolikus klérus társadalmi gyökereinek megismerése céljából. Az állag a források időrendjében egyenkénti átnézéssel kutatható.
Az állag iratait 1941-ig mesterségesen alakítottuk ki, ugyanis az iktatott iratok rendezésekor rengeteg személyi okmány került elő, amelyeket a hallgatók nyújtottak be felvételük alkalmával, s amelyeket keletkezésük időrendjében helyeztünk el. A források értéke nem indokolta név szerinti külön segédlet elkészítését. Az állag második részében már 1958 után keletkezett és külön kezelt iratok találhatók, többek között életrajzok, indexek, a végzett hallgatók adatlapjai, különböző személyi ügyekre vonatkozó dokumentumok. Az modern kori anyag természetesen a személyiségi jogok védelmének figyelembe vételével szigorú korlátozásokkal kutatható. A korábbiak csak egyenkénti átnézéssel.
A szeminárium tanári karának értekezleteiről csak hiányosan maradtak fenn jegyzőkönyvek. A jegyzőkönyvek esetenként bekötött formában maradtak meg, magyar és román nyelvűek. Egyenkénti átnézéssel kutathatók.
Az állagban a kilépett, vagy külföldre távozott hallgatókra vonatkozó nyomtatványok, levelezés található. Az iratok a kilépések időrendjében vannak rendezve. Az anyag nem kutatható.
Az iratok formanyomtatvány jellegűek, tanévenként rendezve. Nyelvük jelentős részben román, esetenként magyar. Az anyag nem kutatható.
A papneveldében készült vizsganyilvántartások az egyes szemináriumok, tantárgyak rendjében vannak elhelyezve a tanéveken belül. Nagyobb részt magyar nyelvűek, esetenként román.
A magyar nyelvű, külön kezelt formanyomtatványok és iratok kronológiai rendben vannak elhelyezve. Az állag anyaga nem kutatható.
Az állagban a szeminárium napi működése során keletkezett péztári okmányok, számlák találhatók. Az iratoknak különösebb forrásértéke nincsen. Megőrzése és levéltárban való elhelyezése a tulajdonos kérésére történt. Gazdaságtörténeti szempontból esetenként érdekes lehet a korszak kutatói számára. Az 1969 előtti időszakból csupán néhány évből maradt fenn kevés dokumentum, 1969-től a sorozat hiánytalan.
A csekély forrásértékű iratokat a tulajdonos kérésére őriztük meg. A nyilvántartások román nyelvűek.
Az állagban vegyes tartalmú nyilvántartó könyveket helyeztünk el. A 19. század első feléből jövedelem összeírások maradtak meg, amelyek restaurálásra várnak. A pénztárnaplók hiányosan állnak rendelkezésre. Kutatásuk egyenkénti átnézéssel lehetséges.
A szeminárium iratai között örvendetes módon teljesen épségben maradtak meg a kispapok által létrehozott irodalmi diáktársaság, a Szalézi Szent Ferencről elnevezett „Irodalmi Iskola” jegyzőkönyvei. Ezek a dokumentumok érdekes forrásai a papnevelde hétköznapjainak. A fentieken kívül még egy Jézus Szíve Társulat jegyzőkönyve is megmaradt. A jegyzőkönyvek egyenkénti átnézéssel kutathatók.
Ebbe az állagba a máshová be nem sorolható, de kutatói érdeklődésre számot tartható iratokat helyeztük el. Az igen vegyes témájú iratok és nyomtatványok egyenkénti átnézéssel kutathatók.